重症肌无力是后天获得性的自身免疫性的疾病，目前认为它的发病机制是胸腺产生的乙酰胆碱受体抗体对神经肌肉接头处，突触后膜上的乙酰胆碱受体发生了攻击，导致突触后膜上的乙酰胆碱受体的减少而得的病。
所以目前认为，重症肌无力是自身免疫性的疾病，是后天获得的疾病。但是在临床上也发现极个别的病人是有着遗传的倾向，有父母亲患重症肌无力，子女也患重症肌无力，而且孩子一出生的时候就已经患重症肌无力，这是极个别、极其罕见的概率。绝大多数重症肌无力的病人，还是后天获得的。