无痛人流手术有可能会人流不全，也就是流不干净。因为人流手术虽然成功率高，但也是95%左右，有可能5%存在人流不全。人流不全发生的原因多方面，有的女性子宫有畸形，比如子宫纵隔、子宫肌瘤、双子宫等等，就容易导致人流不全的出现。
另外，有的女性是因为发生了稽留流产，稽留流产清宫之后因为组织物容易机化，与宫壁粘连紧密，所以也容易清不干净，导致人流不全。还有的因为怀孕周数较大，行人流手术也非常容易出现残留，导致人流不全。