病毒性乙肝的治疗分为两部分：
第一个是保肝治疗，通过静点或口服药物的手段，使患者肝功恢复到正常水平，自觉症状明显改善。
第二个是抗病毒用药，抗病毒用药对于乙肝常见的有两大类，一类是干扰素类用药，干扰素类主要分为长效干扰素和短效干扰素，长效干扰素一周打一针，皮下注射，短效干扰素隔日打一针，皮下注射。
另一类是口服的核苷类似物，口服核苷类似物目前常用的是恩替卡韦和替诺福韦。无论选择哪一种抗病毒药物，最终都要达到DNA的转阴，并有可能出现表面抗原的阴转。