晨起吐痰是褐色的原因首先要判断最近有没有感冒的症状。如果感冒了很可能是合并了上呼吸道的感染、急性咽喉炎，这种情况下会出现咳痰、咳黄痰并有褐色的痰，可以去医院就诊行胸片检查、血常规检查，根据结果用抗生素治疗。
如果不是最近出现，平时就会有咳痰、吐痰，颜色为褐色，就要看病史有没有吸烟，如果有吸烟史而且时间很长考虑是慢性的咽炎引起的，这时候可以口服慢严舒柠或者咽炎片。