胃间质瘤的患病与环境和遗传因素有关。胃间质瘤属于比较罕见的胃部疾病有一定的恶化可能性，所以在发现疾病后应及时进行病理检查，判断疾病的良恶性质。
不少人是由于环境的因素而导致疾病的出现，周围的环境污染程度比较高，经常接触一些重金属的物质或者是在平时有不良的饮食习惯经常暴饮暴食、过度饥饿、不注意休息，这些因素会导致身体免疫力下降并且也是诱发胃间质瘤的常见因素。
胃间质瘤具有一定的遗传因素，家族中有人患有这种疾病直系亲属的患病几率就会增加，所以这些人的直系亲属应当定期到医院进行检查，以便及时发现胃间质瘤的发病。