对于不同程度的甲基丙二酸血症患者，会有不同的存活和预后情况，不能一概而论。
甲基丙二酸血症是常染色体隐性的遗传疾病，分为轻度和重度。轻度的孩子和正常的成人可以有同样的寿命，并不会出现早死亡的情况。而在重症病例中，患者可能在出生后几个月，几个星期就会表现出来症状，也有可能在1岁之内出现夭折。因此对于不同程度的甲基丙二酸血症，会有不同的存活和预后情况。患者表现为嗜睡、生长发育不良、反复发作性的呕吐、脱水、呼吸窘迫和肌张力降低。还有一些孩子稍大一点表现为智力落后、肝脏肿大、昏迷等。有的孩子会出现代谢性的酸中毒和丙酸或者酮尿症，有一些孩子会伴有高氨血症，这些都会严重影响到孩子正常的生长发育和喂养。有些孩子可能会在早期就出现死亡，但是也有一些晚发性病例，如有的孩子在4-14岁之后出现这些症状，相对来说其预后可能较好。孩子在后期经过适当的治疗后，可以像普通成人样那有正常的寿命。
对于甲基丙二酸血症患者，饮食上应该要严格控制蛋白质摄入。对于豆浆、牛奶、鸡蛋、鸡汤、鱼汤和瘦肉的摄入量要进行严格控制，不能多吃。可以吃一些容易消化的低蛋白食物，如苹果、香蕉、梨子、花椰菜、白菜等。