最里面的牙肉肿痛，可以检查是否是智齿萌出所引起的。如果是有智齿正在萌出而引起冠周炎，一般可以口服消炎药，例如头孢或者加甲硝唑片。另外，也可以使用阿莫西林或者罗红霉素等药物。局部可以进行冲洗，到口腔科可以让医生帮忙冲洗，然后局部上碘甘油。另外，口腔内建议使用漱口水，平时避免食物嵌塞于盲袋内。
最里面的牙肉肿痛也有可能是由于对颌牙齿所引起的，比如对颌牙齿比较偏斜或者伸长，有可能咬到局部的肉芽，造成溃疡或者创伤产生疼痛，需要拔除或者将对颌牙齿磨短才能够避免出现牙肉肿痛。另外，如果是阻生智齿萌出，需要在消炎以后拔除阻生智齿，避免引起邻牙的龋坏。