预防血栓的药物包括抗血小板聚集类药物、抗凝药物和抗动脉粥样硬化的药物，具体如下：
第一、抗血小板类药物一般主要针对预防脑动脉血栓，常常见于长期有高血压、糖尿病、高血脂的病人，一般应该给予抗血小板药物，比如阿司匹林、氯吡格雷等口服。
第二、抗凝药物，一般抗凝药物主要针对的是具有心源性的栓塞以及下肢静脉血栓来进行治疗，无论是房颤还是下肢深静脉血栓的预防，都可以应用抗凝药物，比如传统的抗凝药物华法林以及新型抗凝药利伐沙班、达比加群酯等等，还可以应用低分子肝素皮下注射，其中华法林需要经常监测凝血象，一般来说用药不是特别安全，而新型抗凝药一般不需要监测凝血象，但价格昂贵一些。
第三、抗动脉粥样硬化的药物主要是他汀类，比如阿托伐他汀、瑞舒伐他汀、辛伐他汀等等，可以通过抗动脉粥样硬化的角度来减少血栓的发生。