肠易激综合症是肠道功能紊乱性疾病，因为缺乏胃肠道结构和生化异常。
其诊断标准是以证状学为依据，并排除器质性疾病的基础上检查多次，至少3次，大便常规培养、便隐血试验阴性、血、尿常规正常、血沉正常、甲状腺、肝、胆、胰以及肾功能正常，钡剂灌肠X线检查可见结肠充盈迅速及激惹征，但无明显肠结构改变。
年龄超过40岁以上的患者除上述检查以外，还需要进行结肠镜检查并进行黏膜活检排除肠道感染性、肿瘤性疾病等，腹部超声或者CT检查也常用来进行排除器质性疾病引起的相似症状。