百日咳主要是气道内感染百日咳杆菌导致的急性的呼吸道的症状，确诊要知道病人的流行病学史。一般有咳嗽、咳痰的情况，咳嗽呈痉挛性，像鸡叫一样的咳嗽，这时比较典型。临床上主要是靠细菌学培养来确定，可以用病人的痰进行培养。如果培养出来百日咳杆菌，就可以确诊。另外可以用鼻咽拭子培养，如果有阳性发现，也可以确诊。其他的有补体结核试验，查一些百日咳杆菌的抗体，对于确诊帮助，但是不能够确诊。