金银花性偏寒，不适合长期应用，长期应用会损伤脾胃，而诱发脾胃出现虚寒的症状，导致腹泻、肚子不舒服、肚子疼以及恶心、呕吐、食物不消化等等。
如果金银花在冬天应用，副作用就会更加明显，因为金银花的性比较寒，和外界的空气相作用，都是寒性，这样会加重体内的寒邪留滞，而出现一些相关的症状，比如周身怕冷，男性会出现一些肾阳不足的表现，比如腰膝腿软等等。所以金银花在应用过程中，一定要在医生的指导下进行合理的应用，临床上金银花的药用价值还是十分高的，是非常好的清热解毒的药品。