胆道闭锁一旦明确，应当尽早、尽快进行手术治疗。很多胆道闭锁的新生儿由于诊断不明确，或者误认为是其他病理性黄疸，而延误手术时间，最终导致患儿死亡。目前手术方式主要是包括葛西手术和肝移植术，尤其以肝移植术效果最佳。进行葛西手术的新生儿，有时在短时间内可以得到很好的缓解。但是随着时间的延长，病情也有可能进一步进展，最终需要进行肝移植手术。恰当的时机进行肝移植手术，可以使胆道闭锁的新生儿获得很好的生活质量和生存期，甚至可以达到长期生存。进行手术之前应当做好围手术期的处理，以降低术后术中的并发症和死亡率。不过由于目前肝源较为紧张，而且肝移植的费用相对较为高昂，这也对胆道闭锁的新生儿进行手术治疗造成了很大的影响。