儿童睡眠癫痫有可能会被误诊，因为儿童癫痫的临床表现不典型，比较难描述，而且经常见不到癫痫发作，所以容易描述错误，会引起医生的误诊。脑电图表现可以多变，因为小孩的脑电图还没有成熟，在发展过程当中会出现一些生理变化的过程，所以因为脑电图的不典型和临床表现的不典型，容易造成误诊。
通常情况下，需要做长程的视频脑电图，结合临床发作和脑电图的变化，判断癫痫发作类型是不是属于儿童睡眠癫痫。这种情况都需要家长的配合，因为长程视频脑电图一定要有护理在边上，就是看着他的情况，同时因为长程视频脑电图不能离开床边的范围，包括大小便可能都要在床边，吃饭也要在床上吃等。通过长程视频脑电图，可以确认癫痫的发作跟脑电图的关系，可以确诊儿童睡眠癫痫。