灵芝孢子粉的禁忌主要有以下几点：
第一点、容易过敏的患者是不能够吃的，不然的话会出现呼吸道的过敏、出现咳嗽、咳痰、喘憋，甚至呼吸困难，再就是患者皮肤黏膜出现水肿、皮疹，最严重的是引起的喉头水肿、影响呼吸。
第二点、灵芝孢子粉它的禁忌在于会影响消化道，所以有胃炎的患者，特别是严重的胃溃疡的患者，吃灵芝孢子粉一定要禁忌，以防止诱发溃疡处，出现出血甚至穿孔，临床上应该有所警惕。
第三点、灵芝孢子粉的禁忌，儿童尽量少吃或不吃。对于一些特殊体质的人，也应该谨慎应用，包括有一些反应性疾病的人，像内分泌紊乱的患者，都应该禁忌。