病毒细菌感染反复发烧的治疗要去除病因，建议不要自行擅自用药，最好去正规医院就诊。病毒感染会反复的发烧3-5天左右，特殊的病毒感染也可能会发热一周，甚至更久。但是抗病毒药物没有特效药，大多是自限性的疾病，所以在这个过程中，可以口服一点抗病毒的药物，如利巴韦林，还可以用阿昔洛韦注射液等等。
但是如果检查结果提示合并细菌感染，就需要选择合适的抗生素进行抗感染治疗，发热是细菌感染的一种表现，高热用退烧药物，但由于是病毒、细菌的混合感染，所以不建议用激素类的药物进行退热，可以口服布洛芬、对乙酰氨基酚等进行退热处理，同时可以配合物理降温治疗。
并注意多休息、多饮水，不要吃辛辣、刺激的食物，注意勤开窗通风、换气，严密监测患者的体温变化。