拔牙时麻醉部位不会引起疼痛，偶尔会引起轻微的疼痛，但疼痛的时间不会持续太久。最常见疼痛的原因是麻醉药液变质或混入杂质，或未配成等渗溶液，注射针针头钝而弯曲或者有倒钩，均容易损伤组织或神经。
如果注射区持续疼痛，有可能注射区发生软组织感染、注射针被污染，局部或麻药消毒不严或注射针穿过感染灶，均可将感染带入深层组织，引起颞下颌、翼下颌间隙、咽旁间隙的感染，在注射后1-5天局部红、肿、热、痛明显，甚至有张口受限或者开口困难，偶尔引起全身的症状。