女性孕酮低不一定会流产，孕酮低有两种可能，具体如下：
1、会流产：如果确实是黄体功能比较差，低的孕酮不能维持继续妊娠，有可能会产生先兆流产、流产的症状，女性可能会伴有阴道有一些不规则的出血，有一些褐色分泌物，肚子有隐痛，甚至是剧烈疼痛的症状，有可能会先兆流产或者难免流产。
2、不一定会流产：有些女性孕酮虽然低，但是没有任何症状，没有肚子痛、腰酸、阴道出血的症状，一般说明稍微低点的孕酮也可以维持女性的正常妊娠，所以孕酮低不一定会流产，但是孕酮太低，比如小于10ng/mL，最好是在医生指导下，用黄体酮来支持维持妊娠。如果女性的孕酮相对较高，但是仍然有一些先兆流产的症状，也最好是在医生指导下补充孕激素。