在肝性脑病治疗过程中，首先应禁用对肝功能有损害的药物，比如利福平、莫西沙星、脂肪乳等。其次还应避免使用人血白蛋白、呋塞米、氢氯噻嗪等药物，会加重血氨升高，造成低钾血症、低钠血症等。
同时，肝性脑病患者本身就存在意识障碍，因此要避免使用氯硝安定、舒乐安定、奥氮平等具有镇静、安眠作用的药物，以免加重意识障碍的症状。灌肠时不要用肥皂水，肥皂水是碱性的，会加重血氨的蓄积，出现症状加重的情况。可以用乳果糖进行灌肠，改善因为血氨升高而造成的症状。