胃食管反流手术又叫抗反流手术，目前最有效的抗反流手术是腹腔镜、食管裂孔疝的修补术，加上胃底折叠术。由于这种手术属于微创手术，并且全程在麻醉的情况下进行，所以手术过程没有痛苦。这种手术最大的优势是从解剖上恢复了反流的原因，从而在病因上治疗胃食管反流，而且手术能使胃的容积略微缩小，能够加快胃排空，改善消化不良的症状。
因此，对持续存在反流相关的慢性咳嗽、咽喉炎以及哮喘，并且用质子泵抑制剂治疗效果欠佳的难治性反流病，可以考虑进行抗反流手术。总的来说，相对比较重的胃食管反流才考虑接受手术治疗。