甲状腺功能亢进症的育龄期妇女，意外发生了怀孕，或者在妊娠期间出现了甲状腺功能亢进症，这两种情况如何合理的选择抗甲状腺药物是一个非常关键的问题。抗甲状腺药物治疗是妊娠早期的甲状腺功能亢进症患者首选的一个治疗方式，这里所说的妊娠早期是指在妊娠的前三个月。丙硫氧嘧啶是一种抗甲状腺药物，甲巯咪唑也是一种抗甲状腺的药物，这两种药物在临床上使用比较广泛。
与甲巯咪唑相比，丙硫氧嘧啶通过胎盘的剂量仅是甲巯咪唑的1/4，丙硫氧嘧啶引起的胎儿不良反应比甲巯咪唑要少，所以妊娠早期甲亢的治疗首选丙硫氧嘧啶。因为丙硫氧嘧啶容易导致爆发性的肝炎，这也是它的不足之处，所以美国甲状腺协会的指南目前建议在妊娠中期和妊娠的晚期使用甲巯咪唑治疗，在妊娠的早期使用丙硫氧嘧啶治疗。