萎缩性鼻炎的病因不是很明确，治疗主要是对症治疗，比如萎缩性鼻炎通常可以有鼻腔干燥，鼻腔黏膜可以有脓性分泌物，已经形成的结痂。这个情况可以通过用生理盐水或者鼻腔生理性海水做鼻腔冲洗，来将结痂以及脓性分泌物冲洗干净，保持鼻腔黏膜的清洁，从而可以减轻鼻腔干燥以及鼻腔臭味的症状，这是萎缩性鼻炎最常用的治疗方法。
另外，可以适当使用一些促进黏膜分泌的药物临时治疗，比如薄荷滴鼻剂，但不建议长期使用。必要时可以通过一定的手术来缩窄鼻腔，从而改善萎缩性鼻炎通气过度、头痛等相关症状。