疱疹性咽峡炎的一般治疗，就是要适当休息，多饮水，多吃易于消化的饮食；保持室内空气新鲜，并维持适当的温度与湿度，加强护理。注意呼吸道隔离，预防并发症。
有高热或者有高热惊厥史的孩子，要采取积极的降温措施。可以用物理降温，如冰枕、酒精擦浴等方法；或者口服布洛芬、对乙酰氨基酚等药物退烧。
有惊厥要给予止痉处理。缓解症状，可以应用复方感冒制剂，如惠菲宁、泰诺、艾畅；有咳嗽可以用盐酸氨溴索、鲜竹沥口服液；有咽痛可以用银黄含片、草珊瑚含片等对症治疗。假如有鼻塞，可以用含有伪麻美芬的制剂，进行对症治疗。