支原体肺炎主要是由于体内感染到支原体，引起的肺部黏膜的炎症反应。起病相对比较缓慢，大约有1/3的病例没有症状。发病初期有乏力、头痛、咽痛、肌肉酸痛、食欲减退、恶心、呕吐的症状。发热可以高达39℃以上，2-3天之后，会出现明显的呼吸道的症状，比如阵发性的刺激性咳嗽，咳少量的黏液痰或者是黏液脓性痰。有时痰中会带血，发热可以持续2-3周的时间，咳嗽相对比较顽固，热退之后还可以继续咳嗽，并伴随有疼痛。一般少量的病人可伴随有中枢神经的症状，比如脑膜炎、多发性神经根炎，甚至精神失常，还可能出现心肌炎、心包炎的症状等。