磁共振检查收费，根据所在地区等级不同，价格也会有所不同。以二线城市为例，不分医院等级，根据省物价局规定，磁共振平扫0.5-1T，每个部位360元，3.0T及以上，每个部位680元。增强扫描0.5-1T，每个部位400元，3.0T及以上，每个部位960元。
脑功能成像0.5-1T，一次480元，3.0T以上，每次880元。心脏功能检查，0.5-1T，每次480元，3.0T及以上，每个部位960元。磁共振血管成像0.5-1T，每个部位480元，3.0T及以上，每个部位680元。