婴儿出现胎记的原因，可能是在胚胎发育期间由于偶然的因素干扰，导致了皮肤结构的异常出现。有时候有红色的胎记，包括鲜红的斑痣，还有草莓状的血管瘤、海绵状的血管瘤等，都是先天性血管畸形，或者是血管内皮细胞增生所引起，原因至今还不是很清楚。黑色的胎记常常包括太田痣，还有伊藤痣，还有黑色素痣等等，这些也是胚胎发育期间黑色素细胞迁移受到了障碍，导致分布不均匀或者是位置异常引起。
胎记本身就是先天性的，在临床上有白色或黄色的胎记，比如皮脂腺痣、无色素痣、贫血痣等，发生的原因都是胚胎发育期间因为某些因素的干扰所导致。