大部分T波异常的患者都需要治疗，因为T波异常绝大多数提示目前存在某些器质性的疾病，比如存在T波高尖，多提示存在冠状动脉粥样硬化性心脏病、急性心肌梗死的超早期，也叫做超级期。此时需要立即进行抗凝、抗血小板聚集、他汀类调脂药物治疗，才能够有效减少心肌梗死对人体心脏造成的伤害。
如果患者出现T波低平，甚至倒置或冠状T波，很多时候提示可能存在陈旧性心肌梗死。一旦出现陈旧性心肌梗死，非常容易进一步出现心功能不全、心力衰竭，更需要进行抗心衰治疗。此时可以应用降低前负荷的药物，比如应有利尿剂氢氯噻嗪等，也可以应用降低后负荷的药物，比如应用硝酸酯类的药物或者硝普钠等，降低心功能不全对人体带来的伤害。如果患者出现T波的低平倒置，还有可能提示存在有高血压病而引起的心肌损伤，更需要积极控制血压，避免进一步发生心肌损伤。