肝切除是结肠癌肝转移的治疗主要手段，五年生存率可以达到35%到58%，并发症少。多种风险因素是独立预后的标志，包括原发肿瘤的淋巴结是否存在转移、术前CEA水平、无病间隔、肿瘤大小以及转移数量、切除边缘和是否存在肝外转移，综合这些因素可以判断、评价患者接受手术治疗以后的效果。
对于不能切除的病人，全身化疗仍是标准的一线治疗。对于初始不能切除的结直肠癌肝转移，全身化疗能够在一定程度上减少肿瘤负荷，使切除可执行；如果初起是因为解剖位置不允许，术前化疗可使完全切除率达到12.5%到32.5%。最常用的化疗方案还是以FOLFOX和FOLFIRI，最近还采用单克隆抗体，如贝伐单抗或者西妥昔单抗联合化疗，增加治疗的反应率。