EB病毒感染大多数2-4周能好，少数病人可能时间更长，或引起死亡，不能一概而论。
EB病毒感染在儿童大多造成传染性单核细胞增多症，这个病属于自限性的疾病，预后大多是良好的，自然的病程大约在2-4周。少数的孩子恢复比较慢，可能达到数周或者数月，大约有1%-2%的病人可以有严重的并发症而导致死亡。治疗上，可以采用阿昔洛韦、更昔洛韦或者法昔洛韦等抗病毒的药物进行治疗，抗生素对本病无效。对于有些重病人可以采用静脉用的丙种球蛋白，可以使临床的症状改善，缩短病程，早期给药效果更好。严重的病人也可以短期使用肾上腺皮质激素，对于发生脾破裂的病人应该立即输血并进行手术治疗。
EB病毒阳性者应定期到医院耳鼻喉科检查鼻咽部，必要时可行鼻咽部活检、鼻咽部CT等检查，平时注意休息、多喝水。