伪膜性肠炎的症状最主要的表现是腹泻，大多在使用抗生素4-10天之内出现，腹泻的程度和次数不一，轻者每天大便2-3次，一般在停用抗生素之后可以自行痊愈。严重的腹泻患者大便每日可达数十次之多，少数病例还可以在大便中排出斑块状的伪膜。腹痛的表现比较多见，常常伴有腹胀、恶心、呕吐，部分患者会出现毒血症，表现为发烧、心动过速以及定向障碍等，严重者会发生休克、严重脱水、电解质紊乱、少尿甚至是急性肾功衰。
伪膜性肠炎的治疗首先是要停止使用所有的抗菌药物，然后针对相应的症状采取对症治疗，如果有脱水和电解质紊乱以及酸中毒的患者，应该及时的补充电解质和水分，纠正酸中毒，必要时可以给予少量的肾上腺皮质激素来改善毒血症。对于有难辨梭状芽胞杆菌感染的患者可以采用万古霉素、磺胺类药物来进行治疗，如果为爆发性的患者，如果内科治疗效果不明显，有显著的肠梗阻以及中毒性巨结肠时还可以考虑进行结肠切除或者是改造性的回肠造口术来改善症状。