在月经期，子宫内膜会分泌大量的前列腺素，前列腺素不只能促进子宫的收缩，同时也会造成脑部血管的收缩而引起头痛。另外在月经期，血清中的雌激素浓度降低，会引起颅内外血管以及子宫血管对某一些物质，比如5-羟色胺的敏感性，从而引起血管张力的变化，会使一部分敏感的患者发生头痛。在月经后，当血清中雌激素的浓度上升之后，头痛就可以缓解。另外，像精神压力、生活作息不规律、遗传等等，都有可能导致或者加重经期的头痛。