非梗阻性肥厚型心肌病，首先要避免患者情绪激动、过于劳累，同时，要注意避免使用增强心肌收缩力和减轻心脏负荷的药物，比如像洋地黄类以及β受体兴奋剂，比如异丙肾上腺素。除了这些药物之外，还有硝酸甘油类药物，也要尽量不使用，这些药物可能会使左室流出道梗阻加重。建议患者可以使用β受体阻滞剂，这类药物可以减轻流出道梗阻，减少心肌耗氧量，代表药物有普萘洛尔、美托洛尔。对于β受体阻滞剂治疗无效的患者，可以选择应用钙通道阻滞剂，这类药物也可以减轻左心室流出道压差，改善舒张期充盈及局部的心肌血流，其中维拉帕米最为常用。对于伴心律失常的肥厚性心肌病患者，还可以结合应用抗心律失常的药物，对于应用抗心律失常药物无效时，还可以选择进行电复律。