一般认为，儿童和青年时期，阑尾具有发达的淋巴组织，能传输有免疫活性的淋巴细胞，故阑尾可称为免疫器官之一。到成年后，这种免疫功能已被全身淋巴结和脾脏所代替。此外，阑尾黏膜有分泌功能，阑尾壁也有蠕动功能。由此看来，阑尾的功能似乎是使白细胞接触胃肠道内的大量抗原及外来物质。因此，阑尾可以帮助抑制具有潜在破坏作用的体液性抗体反应，同时能够提供局部的免疫作用。阑尾吸收肠道内的抗原，并对其作出反应，这种局部的免疫系统在生理反应以及对食物、药物、细菌或病毒性抗原的控制中发挥了重要的作用。目前科学家正在对这些局部反应，与炎症性肠疾病以及自体免疫反应之间的关系进行研究。