一旦发现有新生儿肺炎，要住院治疗，不经过有效的治疗，自愈的可能性很小。一般治疗原则及时进行呼吸道的管理、雾化吸入、体位引流，定期的翻身拍背，及时吸净口鼻的分泌物。伴有严重肺部胀需要行气管冲洗，供氧，维持血气的氧分压在50-80mmHg之间，轻症给予头罩吸氧。控制感染，考虑细菌感染，病因未明的时候首选第三代头孢菌素，必要的时候联合应用；B族溶血性链球菌感染或者李斯特菌肺炎可以使用氨苄西林；沙眼衣原体和解脲脲原体肺炎首选红霉素。积极的治疗各种并发症，如败血症、化脑、深部的脓肿。要进行支持治疗，保证热量和生理需要量，喂奶以少量多次为宜，避免误吸，不能进食者静脉补液，注意输液不要过快、过多，以免心衰。