矮小症的原因介绍如下：
一、慢性系统疾病，如消化不良、尿毒症、肝肾功能不全、先天性心脏病、慢性的感染可以导致矮小症。
二、内分泌系统的疾病，常见的糖尿病、甲状腺功能减低、皮质醇增多还有甲状旁腺功能减低、垂体功能低下、侏儒症。
三、体质性的矮小，青春发育延迟。
四、遗传性矮小，常见先天性的疾病，宫内生长迟缓，再是中枢神经系统的疾病，如各种的肿瘤、脑积水，常见于下丘脑的肿瘤，还有颅内中线发育缺陷，神经心理的因素。
五、染色体的异常，表现性发育不良、21-三体综合症。其他染色体异常和代谢性疾病都可以导致身材矮小。代谢性疾病、砷中毒、粘多糖沉积症、糖原累积症、抗维生素D性佝偻病等等都是矮小症的原因，要根据病因治疗矮小症。