牙周炎影响正畸，患有慢性牙周炎时牙龈受到牙结石，及牙菌斑的影响发生红肿、出血，形成牙周袋并产生炎性分泌物，不断破坏牙槽骨引起牙龈退缩。
正畸治疗中需要依靠牙槽骨的不断吸收和改建，才能实现牙齿的逐渐移动，牙周炎的患者牙槽骨新生速度明显低于吸收速度，矫治过程中牙齿速度较慢，牙龈容易出现退缩，呈现黑三角，影响美观。
配戴矫治器后更容易黏附食物残渣和软垢，加重牙周炎的程度，有造成牙齿松动、脱落的风险。