中药砂仁的作用主要是化湿开胃，温脾止泻，理气安胎。临床上应用砂仁配伍其它中药，治疗恶心、呕吐等脾胃的症状，对于腹泻和女性妊娠期出现的剧烈恶心、呕吐、胎动不安，都有非常好的疗效。
砂仁的质比较轻，每次用量大约5克左右。砂仁在临床中更多是组成香砂六君子丸等中成药，治疗脾胃虚弱，还可以治疗体内湿气过盛。对于女性来说，可以治疗妊娠期的相关并发症，对于有些患者胎动不安的症状特别明显，可以用砂仁配伍药物进行治疗。