雌激素的检查时间不可一概而论，不同的年龄段其检查的时间有所差异，需告知医生自己所处的时期。
雌激素的检查通常是检查性激素六项，包括黄体生成素、卵泡生成素、雌激素、孕激素、睾酮和泌乳素。但检查时需注意检查的时间，育龄期妇女的月经期和排卵期完全不一样，检查时要告诉医生自己处于哪个时期。雌激素的水平随着月经周期的变化而有所变化，不是一个固定的数值，在绝经期以后由于衰老女性的激素逐渐下降，雌激素和孕激素的水平均有所下降。在更年期以后患者发生骨质疏松、冠心病的几率较没有发生更年期以前明显增多，就是由于雌激素的水平有所下降所导致的。雌激素对心血管系统是一个很好的保护性激素，雌激素检查的时候应该是空腹抽血，尽量说明在哪一个时期抽的血即可。如果患者想检查基础的内分泌，建议在来月经的第2-3天检查性激素六项。如果患者是想检查黄体功能，建议在来月经的前一周抽血。如果患者是想检查在排卵前雌激素的水平，建议在排卵前进行检查。
为避免食物中可能存在的外源性激素等对检测结果有影响，建议患者空腹抽血检查性激素水平，应至少一个月不用性激素类药物，包括黄体酮、雌激素类，否则将影响结果的可靠性。