睡醒口臭要考虑与口腔局部问题有关系，比如口腔卫生做的不到位、睡前没有刷牙的习惯、食物残渣在口腔蓄积，经过一夜的发酵就会产生很多微生物，从而引起口臭。如果有牙龈炎、牙菌斑、牙周炎等情况，也会引起病原微生物大量滋生，从而引起难闻的气味。
另外，很多消化系统的疾病也可以引起这一症状，比如幽门螺杆菌感染者会有口臭，睡醒后尤为明显，而且经过刷牙等措施气味难以消除，比较顽固，如患者有消化不良、脾胃虚弱，也可以出现这种症状。另外，糖尿病患者出现这种症状，不排除是血糖控制不好而引起的酮症酸中毒。所以，口臭原因比较复杂，如果症状存在时间比较长，应该去口腔科、消化科查明原因。