肥厚型梗阻性心肌病的治疗目的主要是减轻左室流出道梗阻的症状，一般有以下四种治疗手段。第一种是药物治疗，通过选用β受体阻滞剂或者钙离子通道阻滞剂减轻梗阻的症状。第二种是经皮室间隔消融术，在药物治疗效果不好，或者不能耐受药物副作用的情况下，患者具有做经皮室间隔消融指征的时候，可以选择这种治疗方法。第三种是通过左室流出道疏通术改善梗阻的症状。第四种是通过安置心脏起搏器改变心室的起搏顺序，以期达到改善左室流出道梗阻的目的。