先天心脏病的病因有下列情况：首先先天心脏病跟遗传因素有关，就是染色体或者基因变异导致，临床上最常见的一种合并先天心脏病的染色体病就是21三体综合症，其他综合征也会有基因部分缺失、变异，也容易合并先天性心脏病。先天性心脏病另外的原因主要是孕妇在孕期尤其是孕早期接触外界环境刺激因素，尤其是在12周之内患有病毒性上呼吸道感染或者感染风疹病毒、巨细胞病毒等，这个期间正好是胎儿心脏形成的关键时期，如果接触和感染这些病毒，就会引起心脏发育畸形。如果用了某些药物或者药物过量，也会引起心脏发育的问题。接触射线也会导致心脏发育的畸形。