先天性心脏病的费用与先天性心脏病的类型有关，也跟所在的城市和省份有关系。在湖南省人民医院，室间隔缺损微创的介入手术，一般在3.5万元以内；房间隔缺损一般在3万元以内；动脉导管未闭，还有肺动脉瓣狭窄、主动脉瓣狭窄一般2.5万元左右。对于大城市比如上海、北京、广州、深圳，费用大概5万元左右。医保的系统不一样，费用也是不一样的，有些地方报销的多，有些地方报销的少，有些地方有大病救助，可以申请免费手术，所以具体的费用也是不一样的。复杂型先天性心脏病，根据具体的程度也是不一样的，在湖南省人民医院一般10万元以内，也有比较复杂的超过10万元。在北京、上海、深圳，一般有10-20万元左右。