阿莫西林不能外用。阿莫西林作为青霉素类的抗生素，外用效果非常弱，而且容易产生耐药菌群。
阿莫西林的作用时间非常短（在外用的情况下），更重要的是不经过试敏可以导致人体出现严重的过敏反应，甚至会出现皮疹、休克以及喉头水肿等生命危险，所以，不建议外用阿莫西林。
阿莫西林在临床的应用范围非常广，抗菌谱也比较广，但是，很多细菌对于阿莫西林都是呈耐药性的，很多细菌对于阿莫西林有相当强的抵抗能力，所以，最好阿莫西林在医生的指导下进行药敏试验，通过药敏试验的结果合理使用阿莫西林，以决定是否在临床中应用这种药物进行灭菌治疗。