因为磁共振检查的范围非常广泛，所以几乎所有的科系都可以开具磁共振检查的申请单。例如检查骨与关节可以挂骨科。检查胸部病变可以挂呼吸科和循环内科。检查盆腔脏器，例如检查子宫卵巢等可以挂妇科。检查直肠、前列腺和膀胱等可以挂肛肠科或者是泌尿科。检查肝胆疾病可以挂消化科。如果检查颅脑外伤、脑血管等可以挂脑外科或者神经内科。检查心血管系统，可以挂心内科或者循环内科等等。