无论是哪种CT在医院的归属都是医院的影像科、放射科。脑CT不是一个独立的CT诊断仪，而是CT的一个功能，在一般的医院里，由于CT的数量有限，一台CT需要检查全身所有器官，例如头部、胸部、腹部、四肢等等。
在有些三甲以上的大型医院内，因为检查CT的病人比较多，而CT诊断仪也较多，所以CT检查会分得很细，会按照部位或者功能进行分类，例如脑CT室、肺CT室，有CT平扫、增强、造影等等分类。