肥厚性心肌病的患者可无自觉症状，一般是因为猝死或者在体检中被发现。很多患者可以有心悸、劳力性呼吸困难或者胸痛、体位改变时出现眩晕，甚至神志丧失等而被发现。如果对于临床心电图表现类似于冠心病的患者，但是患者比较年轻，诊断的冠心病依据不充分，又不能用其他的心脏病解释，应该想到是不是肥厚性心肌病，所以首先应该与冠心病鉴别，一般冠心病发病都是在中年以上，没有胸骨左缘的杂音，通过超声检查就可以明确的诊断。其次，需要与高血压性心肌肥厚鉴别。一般这样的患者都有常年的高血压的病史，同时血压控制不好。超声的检查提示心肌肥厚，如果大于2.5cm时才可以诊断为高血压合并肥厚型心肌病，通过超声检查或者心电图、心导管检查做进一步的诊断。再次，还应该与主动脉瓣狭窄来鉴别。主动脉瓣狭窄的病理性杂音位置会更高，向颈部传导，改变心肌收缩力或者周围阻力的措施对杂音的影响都不大，主动脉瓣第二音减弱，超声心电图可以发现有没有主动脉瓣的病变。最后，还要注意与先天性心脏病鉴别，先天性心脏病一般发病更轻，发病时间更早，通过超声心动图也可以明确的诊断。