肥厚型梗阻性心肌病的治疗主要有药物治疗和非药物治疗。药物治疗的主要目的有：一、减轻左心室流出道梗阻：β受体阻断剂是梗阻性心肌病的一线药物，应该优先选用，可以改善心肌松弛，减少室上性和室性心动过速的发生，减少猝死的发生。二、针对心力衰竭的治疗：当出现左心室扩大、心功能减退时，可以应用β受体阻断剂倍他乐克，应用利尿剂螺内酯，应用强心药地高辛治疗。三、针对房颤的治疗：胺碘酮可以减少房颤的发作，对于持续性房颤可以应用β受体阻断剂倍他乐克控制心室率，应用华法林减少血栓的形成。非药物治疗主要包括：一、手术治疗：对于药物治疗无效、心功能不全，同时存在严重的流出道梗阻患者，需要行室间隔切除术，该手术的手术效果较好。二、室间隔酒精消融术，这项手术的适应症同室间隔切除术，但是对于年龄过大、不易耐受手术的患者可以选择室间隔酒精消融术。对于药物治疗效果差，又不适合手术或室间隔消融的患者，可以置入双腔起搏器治疗。