白蔻仁是常用调节胃肠的药，辛而温，归肺经，也归脾、胃二经。白蔻仁主要功效就是化湿、消除痞满，并且有行气温中的作用，因为是辛温，因此可以消散寒湿。白蔻仁有开胃消食的功要，是一味香料。
白蔻仁通常用于湿浊、阻滞于中焦，阻滞于胃肠，患者出现不思饮食，不想吃饭病症。也用于温病、湿邪初起的时候出现的胸闷、不舒服，不知道饥饿的现象，也用于寒湿的呕吐、心腹的胀痛。白蔻有行气的作用，因此用于治疗食积、消化不良的病症。白蔻要后下，用的是挥发油，久煮之后就没有什么效果了，因此白蔻在煎煮的时候要后下。