现阶段对于除了少数、极少数可疑性病因导致的门静脉高压来说，大部分门静脉高压症是不可治愈的。其治疗的主要要点是预防食管胃底静脉曲张的形成，及预防其破裂出血。肝移植对于肝硬化等原因导致的门静脉高压症可以作为一种治愈的手段，但是因为其花费高、肝脏资源的紧缺，不能作为一种常规的手段用于大部分患者。