乳糖不耐受孩子的治疗，包括以下三个方面：
一、饮食控制，可以给孩子吃无乳糖的配方奶，配方奶是用麦芽糖或葡萄糖来代替乳糖，可以给孩子吃以黄豆为基础的特殊配方奶，当中也不含乳糖。另外可以适当的给孩子增加谷物类食品，也可以给孩子吃酸奶，酸奶当中加乳酸菌发酵，部分的乳糖已经被分解，当孩子腹泻停止后，可以根据孩子的耐受情况，逐渐增加母乳，可以通过混合喂养的方式逐渐过渡。
二、给孩子补充益生菌，益生菌能促进小肠绒毛上皮细胞增生，有利于乳糖酶的恢复，部分益生菌，比如乳酸菌、芽孢杆菌、大肠杆菌都可以产生乳糖酶，酵解乳糖，而有些益生菌是乳糖酶的来源。
三、维持孩子的水电解质平衡，防止发生脱水现象。