治疗角膜炎的基本原则，就是采取一切有效措施，迅速控制感染，争取早日治愈。第一个是散瞳药物，可放大瞳孔，可以减轻虹膜刺激，预防虹膜后粘连，有利于溃疡的愈合，常用的就是0.25%的阿托品眼膏。第二个是抗微生物的治疗，针对引起角膜炎的病原体不同，选用不同的抗微生物药物治疗。细菌性的角膜炎，革兰氏阳性菌引起的角膜炎，可以用头孢唑林滴眼液。如果是革兰氏阴性菌引起的角膜炎，可以选用氨基甙类的药物或者喹诺酮类的药物，譬如妥布霉素滴眼液以及左氧氟沙星滴眼液。真菌引起的角膜炎，要选用那他霉素滴眼液或者氟康唑滴眼液等。棘阿米巴引起的角膜炎，可以选用阳离子防腐剂，比如0.02%的氯己定，还有芳香族双脒类药物，比如常用的0.1%的普罗帕脒，还可以联合氨基糖苷类的抗生素，譬如巴龙霉素和新霉素，与芳香族双脒类药物合用，可以进一步提高疗效。